江戶川柯南原名叫工藤新一，是一名高中生名偵探。在一次追查一個身穿黑衣歹徒時，被其同黨發現並被強迫吃下毒藥而致身體縮小成一個小學生模樣。為了使自己身體回復原狀，計誘歹徒現身找到解藥，工藤新一於是開始設法隱藏身份。他被小蘭發現時，恰好看到了書架上『江戶川亂步全集』及『柯南道爾傑作選』，於是靈感一動，就以『江戶川柯南』之名來掩飾身份。

故事內容 ：
米花市政大樓正在舉行能夠一舉改變全世界遊戲業界價值觀的模擬遊戲「繭」的發表會。結合了最先進技術的「繭」，其遊戲方式是先進入一部外型酷似蠶繭的大型膠囊，透過電腦的操作，讓遊戲者沉睡於歷史上曾經發生過事件的時代，並進行挑戰的虛擬體驗遊戲。柯南、小蘭、灰原以及少年偵探隊的成員們也前往參加發表會，並陰錯陽差的混入政界、財經界以及演藝界等代表人物的小孩群中，趁機乘上了「繭」試玩遊戲。另一方面，「繭」的研發者兼負責人─堅村，竟然在發表會會場遭到殺害。而在這殺人事件發生的同時，一個自稱「諾亞方舟」的人工智慧闖入「繭」的電腦系統，並切斷身處虛擬世界的50名孩童所有能與外界連結的管道。並對現實世界中所有的招待者宣佈：「在這場解決歷史事件的遊戲中，只要有一個人能夠存活到最後就算你們贏。不過如果沒有人能夠存活到最後，參加遊戲的所有人就會葬命於此。」
工藤新一的父親，工藤優作也是這場發表會的特別來賓。優作負責監修「繭」遊戲中的歷史事件，透過推理找出堅村遭到殺害的原因，但關於柯南一行人，他只能在控制室看著他們的表現。一場結合虛擬實境與現實，用50條生命為賭註的遊戲即將展開！